10 октября 1804 года Остин был произведен в чин коммандера и назначен командиром шлюпа
HMS Indian в североамериканских водах.
10 мая 1810 года Чарльз Остин был назначен капитаном 74-пушечного корабля
HMS Swiftsure, флагмана адмирала
[Для просмотра данной ссылки нужно зарегистрироваться]. В сентябре следующего года он получил в командование 32-пушечный фрегат
HMS Cleopatra, а с 20 ноября 1811 года по 30 сентября 1814 года командовал 90-пушечным кораблем
HMS Namur под флагом главнокомандующего в Норе адмирала
сэра Томаса Уильямса.
Во время Ста дней Остин командовал 36-пушечным фрегатом
HMS Phoenix, крейсировал в Адриатическом море. После сдачи Неаполя он отличился при блокаде Бриндизи и захватил два корсарских судна в порту Павоса, но 20 февраля 1816 года потерпел кораблекрушение близ Смирны.
Оказавшись без корабля, Остин был вынужден следующие десять лет провести на берегу. Кроме того, в 1814 году скончалась родами его жена
Фрэнсис Палмер и на руках у него осталось три дочери. В заботе о детях ему помогала старшая сестра покойной жены
Харриет Палмер, на которой он впоследствии женился. Во втором браке у него родились трое сыновей и дочь.
2 июня 1826 года Чарльз Остин был назначен командиром 46-пушечного фрегата
HMS Aurora, командуя которым он участвовал в перехвате работорговых судов в Южной Америке. В декабре 1828 года Остин был назначен командиром 40-пушечного фрегата
HMS Winchester под флагом главнокомандующего в североамериканских водах
сэра Эдварда Колпойса и в декабре 1830 года, будучи больным, вернулся на родину.
14 апреля 1838 года Чарльз Остин был назначен командиром 80-пушечного корабля
HMS Bellerophon в
[Для просмотра данной ссылки нужно зарегистрироваться], участвовал в боевых операциях у побережья Сирии и 3 ноября 1840 года отличился при бомбардировке Акры, за что 18 декабря того же года был
награждён орденом Бани.
9 ноября 1846 года Чарльз Остин был произведен в чин контр-адмирала и с 14 января 1850 года по 7 октября 1852 года занимал пост главнокомандующего военно-морских сил в Ост-Индии и Китае, возглавлял военно-морские силы в течение второй англо-бирманской войны.
Умер Чарльз Джон Остин от холеры 7 октября 1852 гола в Проме в возрасте семидесяти трех лет.