В 1644 году Флорис стал экстраординарным капитаном Адмиралтейства Западной Фрисландии; на самом деле он им был не более чем на время призыва, который организовывался единовременно для расширения действующего флота под конкретную цель. В 1647 году командовал двумя кораблями, которые Монникендам в том году передал флоту Западной Фрисландии. В 1652 году разразилась Первая англо-голландская война и появились большие возможности для карьеры. В том году Питер Флорис был назначен капитаном и с 15 мая почти сразу же был задействован в качестве исполняющего обязанности контр-адмирала и командира эскадры, по-видимому, только из-за старшинства, поскольку он был старшим из имевшихся на тот момент капитанов. В сражении у мыса Дандженесс Флорис действовал в качестве командира эскадры, будучи на корабле, отремонтированном после шторма в августе. В 1653 году выступал в качестве исполняющего обязанности вице-адмирала эскадры в Портлендском сражении на
Monnickendam (36 пушек), на корабле, капитаном которого был с 1651 года; мачты его корабля были отстрелены, и после того, как английский флот начал преследование, позволил отбуксировать корабль на Тексель. За свою храбрость — в первый день битвы он повёл свой корабль в нападение на авангард адмиралов
Уильяма Пенна и
[Для просмотра данной ссылки нужно зарегистрироваться], с целью взять их на абордаж — он был награждён Генеральными штатами
почётной золотой цепью. Во время сражения при Габбарде и сражения при Схевенингене он был командиром эскадры на
Monnickendam. В том бою он вступил в дуэль с
Andrew контр-адмирала
[Для просмотра данной ссылки нужно зарегистрироваться], который был убит в бою.
11 ноября 1653 года был назначен вице-адмиралом Адмиралтейства Западной Фрисландии, который был самым высоким рангом в Адмиралтействе. В декабре умерла его вторая жена. В январе 1654 года он переехал в Хорн по просьбе городского совета этого города. В августе 1654 года он женился во второй раз.
В июне 1656 года Флорис присоединяется к экспедиции против Швеции с целью снятия блокады с Данцига. В 1657 году он входил в состав флота, который в ходе голландско-португальской войны блокировал побережье Португалии.
8 ноября 1658 года Питер Флорис был убит во время освобождения Копенгагена в качестве командира арьергарда на
Jozua в сражении в Эресунне против шведов. Его тело было забальзамировано и передано датчанами с большими почестями. 8 ноября 1659 года состоялись государственные похороны в Гроте Керк в Хорне, где позже была возведена мраморная гробница, произведение Питера ван Кампфорта, которая в значительной степени будет утрачена во время пожара в 1838 году. Мраморное покрытие и деревянная крышка гроба сохранились, они находятся в коллекции Западно-фризского музея. Флориса сменил
[Для просмотра данной ссылки нужно зарегистрироваться]; его вдова получила единовременное пособие в размере 3000 гульденов.
В 2010 году на доме, где жил Питер Флорис в Монниккендаме, поставили памятную доску. Официально это было празднование 655-летия городских прав, но таким образом Питер Флорис также был удостоен памяти как житель города.